南投縣政府環保局於108年12月25日會同南投地檢署及行政院環保署督察大隊查獲南崗工業區內一家工廠繞流排放空氣污染物，並涉嫌短報空污費，除追繳約2172萬元空污費外，全案現已移交司法審查中。環保局審視轄內各工廠空污費申報情形，判斷仍有部分廠商有短報空污費情形，故於109年起將分階段辦理專案查核。

109年7月優先邀集7家表面塗裝業者召開專案會議，由環保局方信雄局長主持，會中說明空污費相關法規、短漏報空污費可能涉及之罰則，並要求業者自主檢視所申報空污費金額是否正確，並檢附相關原(物)料購買憑證等相關資料至環保局查對。針對申報錯誤須進行補繳者，將由環保局核定應申報及須補繳金額。環保局依據7家工廠自主提報之原(物)料購買憑證重新核算，確認有申報錯誤情形，合計應補繳金額約710萬元。

環保局方信雄局長表示，環保局將持續進行專案查核，而業者亦應導正短報空污費的錯誤觀念，因空污費是秉持污染者付費的精神，業者可投入更多改善作業，降低污染物排放量，即可減少空污費金額，達到雙贏目的。同時呼籲業者可自行檢視相關原(物)料購買憑證與空污費申報原物料使用量或產品產量是否一致，倘有錯誤申報者，可提供相關資料至環保局重新核算空污費。而工廠對於空污費申報作業如有任何疑問，或需要環保局協助者，可撥打環保局(049) 2207301或(049) 2233753洽詢，環保局會有專人進行服務。