許可申請除電子網路傳輸及書面文件送審，亦需檢附目的事業主管機關核准設立、登記或營運之相關證明文件影本，及其他經主管機關指定之文件如：
(一) 工廠登記資料。
(二) 公司設立登記資料。
(三) 地籍資料。
(四) 負責人基本資料。
(五) 廢棄物清理許可證(從事廢棄物處理程序需檢附)。
(六) 再利用登記檢核文件(從事廢棄物再利用需檢附)。
(七) 屠宰登記證(從事屠宰作業程序需檢附)。
(八) 環境影響說明書、評估書所載內容及審查結論(應實施環境影響評估者需檢附)。